Ilościowa analiza porównawcza wybranych gatunków archeonów przewodu pokarmowego wśród pacjentów z nowo rozpoznaną celiakią oraz analiza dynamiki zmian w czasie, podczas stosowania diety bezglutenowej
Kierownik projektu: mgr Agnieszka Krawczyk
Okres realizacji: 2020 - 2021
Skład mikrobioty przewodu pokarmowego ma fundamentalne znaczenie w utrzymywaniu wewnętrznej równowagi i stanu zdrowia człowieka, a zmiana ilościowa i/lub jakościowa mikroorganizmów jest ważnym czynnikiem indukującym procesy patologiczne.Wnikliwe zrozumienie zachodzących interakcji pomiędzy drobnoustrojami a organizmem gospodarza może dostarczyć nowych informacji na temat etiologii chorób,a także nowych sposobów zapobiegania i leczenia niektórych jednostek chorobowych.W ostatnim czasie,dużą uwagę zwraca się na rolę dysbiozy jelitowej w indukcji celiakii (CoeD).O ile udział bakterii czy grzybów w patogenezie CoeD stanowi coraz częstszy przedmiot badań,to nie uwzględniano do tej pory roli archeonów,które również stanowią istotny składnik mikrobioty jelitowej,a których udział w patogenezie wielu chorób przewlekłych,jak: nieswoiste zapalenia jelit, otyłość,cukrzyca wydaje się być znaczący.Niewykluczone jest,że zmiana liczebności czy składu arecheonów wśród osób predysponowanych genetycznie do CoeD,może mieć fundamentalne znaczenie w aktywacji komórek T-specyficznych dla glutenu poprzez modyfikację peptydów glutenowych i zwiększeniu ich immunogenności.Zasadniczym problemem w ocenie ewentualnej roli tych drobnoustrojów w patogenezie chorób człowieka,jest trudność w ustaleniu ich obecności i liczebności,gdyż większość z nich należy do grupy mikroorganizmów niedających się hodować na podłożach sztucznych.Dokładne badania,w których można ocenić nie tylko obecność i liczebność archeonów,ale także określić gatunek,prowadzone są z wykorzystaniem technik biologii molekularnej.Stwierdzenie ewentualnych nieprawidłowości archeobiomu być może pozwoli w przyszłości na wdrożenie środków prewencyjnych w celu modyfikacji mikrobioty przewodu pokarmowego.Analiza dynamiki zmian liczby archeonów w czasie-podczas stosowania diety bezglutenowej,pozwoli stwierdzić czy ewentualna dysbioza jest czynnikiem wyzwalającym zachorowanie na celiakię czy jest to efekt stosowania diety bezglutenowej.Wobec powyższych,za cel niniejszego badania postawiono sobie jakościową i ilościową analizę wybranych gatunków archeonów wśród pacjentów z CoeD z wykorzystaniem techniki qPCR.