Wielokierunkowa analiza mikrobiomu jelitowego, w tym wiriomu, archeomu, bakteriobiomu i mykobiomu, oraz profilu genetycznego i immunologicznego u pacjentów z nieswoistymi zapaleniami jelit - związek z patogenezą i odpowiedzią na leczenie biologiczne
Kierownik projektu: dr Agnieszka Krawczyk
Okres realizacji: 2026-2030
Rodzaj projektu: OPUS 29 Opis projektu
Ocena przydatności sekwencjonowania NGS i profilowania mikrobiomu-DynaMAP do analizy zaburzeń składu mikrobioty i identyfikacji patogenów w przebiegu biegunek o nieustalonej etiologii u pacjentów z nowotworami krwi
Kierownik projektu: dr Agnieszka Sroka-Oleksiak
Okres realizacji: 2023-2024
Rodzaj projektu: Miniatura 7 Opis projektu
Analiza zmian w składzie bakteryjnej mikrobioty jelitowej u szczurów otyłych po przezczaszkowej stymulacji prądem stałym - badania pilotażowe z zastosowaniem metody sekwencjonowania nowej generacji
Kierownik projektu: dr Katarzyna Talaga-Ćwiertnia
Okres realizacji: 2023-2024
Rodzaj projektu: Miniatura 7 Opis projektu
Ocena mikrobiomu i proteomu mózgu oraz roli przeszczepu mikrobioty jelitowej (FMT) w schizofrenii – badania na szczurzym modelu MAM-E17
Kierownik projektu: dr Dominika Salamon
Okres realizacji: 2022 – 2025
Rodzaj projektu: Sonata 17 Opis projektu
Analiza metagenomiczna archeobiomu i mykobiomu jelitowego dzieci z chorobą Leśniewskiego-Crohna w porównaniu do osób zdrowych
Kierownik projektu: mgr Agnieszka Krawczyk
Okres realizacji: 2020 – 2023
Rodzaj projektu: Preludium 17 Opis projektu
Szczury, schizofrenia oraz bakteryjny i grzybiczy mikrobiom jelit - badanie pilotażowe z wykorzystaniem sekwencjonowania nowej generacji (NGS)
Kierownik projektu: dr Dominika Salamon
Okres realizacji: 2019 – 2021
Rodzaj projektu: Miniatura 3 Opis projektu
Analiza metagenomiczna bakteriobiomu i mykobiomu przewodu pokarmowego dzieci i młodzieży z celiakią i ich zdrowego rodzeństwa oraz dzieci zdrowych posiadających antygen HLA DQ2 i (lub) DQ8
Kierownik projektu: dr hab. Tomasz Gosiewski, prof. UJ
Okres realizacji: 2018 – 2023
Rodzaj projektu: Sonata Bis 7 Opis projektu
Charakterystyka immunogennych białek Streptococcus agalactiae wraz z identyfikacją epitopu rozpoznawanego przez przeciwciała ochronne krwi pępowinowej
Kierownik projektu: dr hab. Monika Brzychczy - Włoch, prof. UJ
Okres realizacji: 2014 – 2018
Rodzaj projektu: Opus 5
Spektroskopia Ramana jako narzędzie diagnostyczne w identyfikacji bakterii atypowych i beztlenowych układu rozrodczego: badanie pilotażowe nad mikrobiologicznymi czynnikami ryzyka niepłodności
Kierownik projektu: dr Agnieszka Gonet-Surówka
Okres realizacji: 2025 – 2027
Ocena skuteczności metody hodowli w detekcji zakażeń krwi u pacjentów
Kierownik projektu: prof. Tomasz Gosiewski
Okres realizacji: 2025 – 2026
Optymalizacja przygotowania próbek biologicznych do badań proteomicznych oraz korelacja proteomu ze składem mikrobiomu oznaczonym przy zastosowaniu metody sekwencjonowania NGS
Kierownik projektu: prof. Monika Brzychczy-Włoch
Okres realizacji: 2024 – 2025
Ocena aktywności metabolicznej wczesnego biofilmu bakteryjnego z wykorzystaniem metody fluorymetrycznej na różnych powierzchniach biomateriałów
Kierownik projektu: mgr Kamil Drożdż
Okres realizacji: 2024 – 2025
Analiza wybranych mikroorganizmów jelitowych w przebiegu schizofrenii - badanie oparte na szczurzym modelu choroby z zastosowaniem metody Real-Time PCR
Kierownik projektu: dr Agnieszka Krawczyk
Okres realizacji: 2024 – 2025
Analiza archeonów przewodu pokarmowego szczurów otyłych poddanych przezczaszkowej stymulacji prądem stałym przy zastosowaniu metody sekwencjonowania następnej generacji
Kierownik projektu: dr Katarzyna Talaga-Ćwiertnia
Okres realizacji: 2024 – 2025 Opis projektu
Opracowanie sond FISH do detekcji drobnoustrojów in situ w systemie znakowania obustronnego, za pomocą zewnętrznego, uniwersalnego oligonukleotydu
Kierownik projektu: prof. Tomasz Gosiewski
Okres realizacji: 2023 – 2024 Opis projektu
Ocena archeobiomu jelitowego w schizofrenii - badania na modelu szczurzym
Kierownik projektu: dr Dominika Salamon
Okres realizacji: 2023 – 2024 Opis projektu
Zastosowanie metody sekwencjonowania nowej generacji do analizy mykobioty jelitowej u szczurów otyłych poddanych przezczaszkowej stymulacji prądem stałym
Kierownik projektu: dr Katarzyna Talaga-Ćwiertnia
Okres realizacji: 2022 – 2023 Opis projektu
Opracowanie i standaryzacja metod badania wiriomu człowieka przy zastosowaniu metody sekwencjonowania nowej generacji (NGS)
Kierownik projektu: prof. dr hab. Monika Brzychczy-Włoch
Okres realizacji: 2022 – 2023 Opis projektu
Opracowanie metody identyfikacji gatunkowej bakterii z zastosowaniem spektroskopii ramanowskiej i sztucznej inteligencji – badania pilotażowe
Kierownik projektu: dr Agnieszka Sroka-Oleksiak
Okres realizacji: 2022 – 2023 Opis projektu
Wpływ disulfiramu (DSF) na namnażanie się i wzrost atypowych bakterii z rodzaju Ureaplasma (U. urealyticum, U. parvum)
Kierownik projektu: dr Małgorzata Biernat - Sudolska
Okres realizacji: 2022 – 2023 Opis projektu
Bakteryjne RNA - molekularny biomarker w aktywnych zakażeniach krwi u pacjentów z sepsą
Kierownik projektu: dr Agnieszka Sroka-Oleksiak
Okres realizacji: 2020 – 2021 Opis projektu
Ocena aktywności przeciwbakteryjnej kwasu liponowego w stosunku do atypowych bakterii z rodziny Mycobacteriaceae
Kierownik projektu: dr Małgorzata Biernat - Sudolska
Okres realizacji: 2020 – 2021 Opis projektu
Badania nad zastosowaniem innowacyjnych metod zwalczania biofilmów bakteryjnych na polietylenowych i poliwinylowych rurkach tracheostomijnych u pacjentów po wykonanym zabiegu tracheostomii
Kierownik projektu: dr hab. Monika Brzychczy - Włoch, prof. UJ
Okres realizacji: 2020 – 2021
Ocena tworzenia biofilmu przez izolaty kliniczne Klebsiella pneumoniae na biomateriałach wykorzystywanych w produkcji rurek tracheostomijnych
Kierownik projektu: mgr Dorota Ochońska
Okres realizacji: 2020 – 2021 Opis projektu
Ilościowa analiza wybranych gatunków bakteryjnego i grzybiczego mikrobiomu przewodu pokarmowego w przebiegu indukowanej farmakologicznie schizofrenii w modelu szczurzym
Kierownik projektu: dr Dominika Salamon
Okres realizacji: 2019 – 2021
Znaczenie mieszanych zakażeń wirusowych w nieczerniakowych rakach skóry HPV-zależnych
Kierownik projektu: mgr Jolanta Kopeć
Okres realizacji: 2019 - 2020 Opis projektu
Badanie przesiewowe ujemnych próbek krwi pod kątem możliwości występowania śladowych ilości bakterii przy użyciu szybkiej metody identyfikacji FISH
Kierownik projektu: mgr Joanna Sobońska
Okres realizacji: 2019 - 2020
Zmiany genetyczne i epigenetyczne papillomawirusów o wysokim potencjale onkogennym w kontekście zdolności do integracji wirusa z komórką gospodarza i mechanizmów nowotworzenia
Kierownik projektu: dr hab. Sława Szostek
Okres realizacji: 2018 - 2022
Charakterystyka fenotypowa i genotypowa szczepów wirusów opryszczki klasyfikowanych do odrębnych gatunków, HSV-1 i HSV-2
Kierownik projektu: dr hab. Barbara Zawilińska
Okres realizacji: 2018– 2022
Ilościowa analiza porównawcza wybranych gatunków bakterii beztlenowych jelita grubego u dzieci z chorobą Leśniowskiego - Crohna w grupie pacjentów leczonych żywieniowo oraz w grupie pacjentów poddanych terapii biologicznej
Kierownik projektu: dr Dominika Salamon
Okres realizacji: 2017 - 2018
Ocena ilościowa grzybów z rodzaju Candida w grupie dzieci z chorobą Leśniowskiego -Crohna leczonych żywieniowo i terapią biologiczną w porównaniu do dzieci
Kierownik projektu: dr hab. Tomasz Gosiewski, prof. UJ
Okres realizacji: 2017 - 2018
Ocena aktywności przeciwwirusowej in vitro kwasu liponowego, kwasu 2-merkaptoetanosulfonowego, N-acetylocycteiny oraz kwasu elagowego względem wybranych wirusów DNA i RNA
Kierownik projektu: dr Małgorzata Biernat - Sudolska
Okres realizacji: 2017 - 2018
Ocena składu flory dróg rodnych kobiet analizowana w kolejnych trzech trymestrach ciąży przy zastosowaniu metody sekwencjomowania nowej generacji
Kierownik projektu: dr hab. Monika Brzychczy - Włoch
Okres realizacji: 2017 - 2018
Ocena występowania zmian trądzikowych o etiologii Propionibacterium acnes w latach 2008-2012 w Małopolsce
Kierownik projektu: mgr Joanna Sobońska
Okres realizacji: 2017 - 2018
Genotypowanie metycylinoopornych Staphylococcus aureus w oparciu o badanie zmienności liczby powtórzeń tandemowych VNTR z wykorzystaniem metody MLVA
Kierownik projektu: mgr Dorota Ochońska
Okres realizacji: 2017 - 2018
Badania nad tworzeniem biofilmu oraz adherencja do ustalonych linii komórkowych izolatów klinicznych Streptococcus agalactiae pochodzących z zakażeń układu moczowego od dorosłych pacjentów
Kierownik projektu: dr hab. Monika Brzychczy-Włoch
Okres realizacji: 2015 - 2015
Zmienność genotypowa HPV o wysokim potencjale onkogennym, a postacie wirusowego genomu w procesie onkogenezy szyjki macicy
Kierownik projektu: dr hab. Sława Szostek
Okres realizacji: 2015 - 2017
Swoista odpowiedź immunologiczna a podatność na wtórne zakażenia herpeswirusowe
Kierownik projektu: dr hab. Barbara Zawilińska
Okres realizacji: 2015 - 2017
Zaburzenia mikrobiomu jamy ustnej w przebiegu wybranych chorób układu krążenia
Kierownik projektu: lek. dent. Barbara Brzychczy
Lata realizacji 2022 – 2023 Opis projektu
Analiza zmian składu mykobiomu w czasie u pacjentów pediatrycznych z chorobą Leśniowskiego – Crohna leczonych przeciwciałami anty-TNF-α
Kierownik projektu: mgr Agnieszka Krawczyk
Okres realizacji: 2022 - 2024 Opis projektu
Badaniami nad zastosowaniem innowacyjnych metod zwalczania biofilmów bakteryjnych na polimerowych materiałach implantacyjnych
Kierownik projektu: mgr Kamil Drożdż
Okres realizacji: 2022 - 2023 Opis projektu
Ilościowa analiza porównawcza wybranych gatunków archeonów przewodu pokarmowego wśród pacjentów z nowo rozpoznaną celiakią oraz analiza dynamiki zmian w czasie, podczas stosowania diety bezglutenowej
Kierownik projektu: mgr Agnieszka Krawczyk
Okres realizacji: 2020 - 2021 Opis projektu
Funkcjonalizacja powierzchni biomateriałów polimerowych do dedykowanych zastosowań implantacyjnych
Kierownik projektu: lek med. lek dent. Łukasz Ścibik
Okres realizacji: 2019 - 2021
Ocena właściwości przeciwdrobnoustrojowych stopów miedzi i wybranych metali metodami: spektrofluorometrycznymi, mikroskopowymi oraz cytometrią przepływową
Kierownik projektu: dr Agnieszka Sroka-Oleksiak
Okres realizacji: 2017 - 2018
Charakterystyka klinicznych szczepów Streptococcus agalactiae o fenotypie oporności MLSβ przy zastosowaniu typowania metodą MLST
Kierownik projektu: dr Anna Dobrut
Okres realizacji: 2017 - 2018
Profesjonalna, komercyjnie dostępna baza danych zawierająca zdjęcia z preparatów mikroskopowych wybranych gatunków mikroorganizmów do zastosowań w uczeniu maszynowym
Kierownik projektu: prof. Monika Brzychczy-Włoch
Okres realizacji: 2024 – 2025
MicroAIvag - Innowacyjne wykorzystanie sztucznej inteligencji do diagnostyki zakażeń pochwy
Kierownik projektu: prof. dr hab. Monika Brzychczy-Włoch
Lata realizacji 2025 – 2026
