Model wielospecjalistycznej opieki szpitalnej i pozaszpitalnej nad pacjentem z zakażeniem SARS-CoV-2
Kierownik podprojektu (mikrobiologia): dr hab. Tomasz Gosiewski, prof. UJ
Lata realizacji 2020 – 2021
Tytul podprojektu: Badania nad diagnostyką labolatoryjną zakażeń wywołanych przez wirusa SARS-CoV-2 w przebiegu choroby COVID-19
Rodzaj projektu: Wsparcie szpitali jednoimiennych w walce z rozprzestrzenianiem się zakażenia wirusem SARS-CoV-2 oraz w leczeniu COVID-19
W ramach realizowanego projektu proponujemy opracowanie testu opartego o fluorescencyjną hybrydyzację in situ (FISH), różnicującego wirus SARS-CoV-2 z wirusami grypy, co może pomóc w szybkiej detekcji COVID-19 i/lub grypy. Test będzie oparty o analizę preparatu mikroskopowego fluorescencyjnego z wymazu z górnych dróg oddechowych od pacjenta z objawami sugerującymi COVID-19. Pod wpływem promieni UV w komórkach nabłonka dróg oddechowych zawierających RNA wirusa będzie można zaobserwować intensywne świecenie w jaskrawym kolorze.
Wykrycie zakażania wirusem SARS-CoV-2 jest kluczowym elementem stwierdzenia u pacjenta z objawami infekcji dróg oddechowych choroby COVID-19 lub jej wykluczenia w przypadku zakażenia innymi patogenami. Badaniem referencyjnym jest test molekularny PCR oparty o wykrycie co najmniej dwóch genów charakterystycznych dla wirusa w próbce wydzieliny z dróg oddechowych. Opracowanie alternatywnych molekularnych (a więc bardzo dokładnych), metod diagnostycznych jest pożądane, ponieważ w ten sposób zwiększą się możliwości rozpoznawania zakażeń, co powinno poprawić efektywność kontroli nad przebiegiem epidemii COVID-19.
Równoległym ramieniem badania będzie sprawdzenie czy u pacjenta współistnieje zakażenie innym patogenem (np. wirusem grypy czy RSV) i czy to wpływa na ciężkość przebiegu COVID-19. Taka wiedza pozwoli w przyszłości na rokowanie przebiegu klinicznego zakażenia. To badanie będzie przeprowadzone przy pomocy komercyjnych testów PCR, tzw. „paneli oddechowych” umożliwiających wykrycie innych patogenów w próbce.
https://cracov.cm-uj.krakow.pl/pl/podprojekty/mikrobiologia-i-diagnostyka/